引 言

蛋白質(zhì)和長肽在生物體系中扮演著至關(guān)重要的角色，并且它們是許多重要治療藥物的構(gòu)成要素。然而，這些生物分子的研究進(jìn)展常常受到基于時(shí)間密集型表達(dá)技術(shù)和原生化學(xué)連接方法的限制。固相多肽合成（SPPS）為直接合成具有特定序列的蛋白質(zhì)提供了一種途徑，并能夠迅速產(chǎn)生結(jié)構(gòu)類似物。盡管如此，由于在合成過程中雜質(zhì)的累積和產(chǎn)物聚集的傾向，長肽和蛋白質(zhì)的SPPS合成面臨著不小的挑戰(zhàn)。在早期，SPPS主要被應(yīng)用于生產(chǎn)較短的片段，以便進(jìn)行原生化學(xué)連接，而對(duì)于較長序列的合成能力相對(duì)受限[1]。近來，快速流動(dòng)式合成方法展示了其以極短周期時(shí)間組裝長序列的顯著潛力。但這種方法的一個(gè)缺點(diǎn)是，它需要使用大量的氨基酸（通常是≥ 100當(dāng)量），并且伴隨著大量廢物的產(chǎn)生。

微波加熱技術(shù)現(xiàn)在已經(jīng)被普遍應(yīng)用于多肽合成，并且已經(jīng)證實(shí)其能夠有效地克服肽鏈聚集的難題，并促進(jìn)困難反應(yīng)的順利進(jìn)行[3,4]。通過結(jié)合優(yōu)化的碳二亞胺耦合條件和微波加熱（CarboMAX™ 技術(shù)），可以實(shí)現(xiàn)最小程度的差向異構(gòu)化，并且與傳統(tǒng)使用鏻鹽和強(qiáng)堿的更為激烈激活方法相比，能夠?qū)崿F(xiàn)更高純度的合成效果。此外，采用無需中間排放步驟的一鍋法耦合和脫保護(hù)流程，使得整個(gè)過程更加迅速和高效。

在2022年，推出了新一代的微波肽合成器系列——Liberty PRIME 2.0和Liberty Blue 2.0。這些先進(jìn)設(shè)備采用了創(chuàng)新的頂部沖洗技術(shù)，該技術(shù)在肽合成過程中能夠保持反應(yīng)容器表面的清潔度。通過預(yù)防揮發(fā)性試劑的再冷凝，頂部沖洗技術(shù)有效避免了對(duì)后續(xù)反應(yīng)的污染。隨著長蛋白質(zhì)合成的進(jìn)行，每個(gè)反應(yīng)步驟中即使是微小的純度提升也會(huì)累積起來，最終轉(zhuǎn)化為整體純度的顯著提高。利用Liberty PRIME 2.0，成功合成了一系列具有挑戰(zhàn)性的蛋白質(zhì)，包括76個(gè)氨基酸的泛素、86個(gè)氨基酸的胰島素原、89個(gè)氨基酸的巴氏蛋白、99個(gè)氨基酸的類膠原蛋白序列和HIV蛋白酶，以及127個(gè)氨基酸的MDM2。

圖1. Liberty PRIME 2.0

蛋白質(zhì)合成流程經(jīng)過精心優(yōu)化，僅需要10到20當(dāng)量的氨基酸，平均每個(gè)合成周期只需大約7.5分鐘，這樣的高效率使得目標(biāo)蛋白可以在一晚上的時(shí)間內(nèi)（每輪運(yùn)行10至17小時(shí)）以較高的初始純度完成合成。到了第二天，所合成的蛋白質(zhì)便被分離并轉(zhuǎn)移到Prodigy純化系統(tǒng)，在那里它們通過60°C的升溫色譜法得到進(jìn)一步凈化。這一氵?程不僅速度迅捷，而且試劑的使用也木及具效率（詳見表1）。

材料與方法

試 劑

從CEM Corporation（Matthews, NC）獲得的以下Fmoc氨基酸包含所示的側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán)：Ala, Asn(Trt), Arg(Pbf), Asp(OMpe), Asp(OtBu)-(Dmb)Gly, Cys(Trt), Gln(Trt), Glu(OtBu), Gly, His(Boc), Ile, Leu, Lys(Boc), Phe, Pro, Met, Ser(tBu), Thr(tBu), Trp(Boc), Tyr(tBu), 和 Val。Rink Amide ProTide™ LL樹脂（0.20 meq/g替代）也來自CEM Corporation。N,N’-二異丙基碳二亞胺（DIC）、吡咯烷、三氟乙酉夋（TFA）、3,6-二氧雜-1,8-辛二硫醇（DODT）和三異丙基硅烷（TIS）來自Sigma-Aldrich（St. Louis, MO）。二氯甲烷（DCM）、N,N-二甲基甲酰胺（DMF）、無水乙酉迷（Et2O）和乙酸來自VWR（West Chester, PA）。LC-MS級(jí)水（H2O）和LC-MS級(jí)乙腈（MeCN）來自Fisher Scientific（Waltham, MA）。

蛋白質(zhì)合成

蛋白質(zhì)合成在CEM Liberty PRIME 2.0自動(dòng)化微波肽合成儀上進(jìn)行，采用Rink Amide ProTide® LL樹脂，合成規(guī)模為0.05或0.1毫摩爾。脫保護(hù)步驟使用DMF中的吡咯烷進(jìn)行處理。偶聯(lián)反應(yīng)則通過使用10或20當(dāng)量的Fmoc保護(hù)氨基酸與DIC和Oxyma Pure在DMF中反應(yīng)（遵循改良的CarboMAX方案）。蛋白質(zhì)的切割在室溫或38°C下進(jìn)行，使用的是TFA/H2O/TIS/DODT混合物。切割完成后，蛋白質(zhì)通過乙酉迷沉淀并經(jīng)過夜凍干處理以獲得最終產(chǎn)品。

蛋白質(zhì)純化

蛋白質(zhì)通過裝備有Intrepid C18, 21.2 mm x 250 mm, 5 μm色譜柱的Prodigy系統(tǒng)上的高溫HPLC進(jìn)行純化。粗蛋白首先溶解在水中并過濾后注射進(jìn)樣。分離在40或60°C下進(jìn)行，使用含有0.1% TFA的(i)水和(ii)乙腈的梯度洗脫。

蛋白質(zhì)分析

蛋白質(zhì)在裝備有Q Exactive plus MS的ThermoFisher UPLC系統(tǒng)上進(jìn)行分析，使用Acquity UPLC BEH C8色譜柱（1.7 mm x 100 mm）。峰分析在Chromeleon軟件上完成。分離使用含有0.05% TFA的(i)水和(ii)乙腈的梯度洗脫進(jìn)行。

成 果

表1. 每種蛋白質(zhì)的合成時(shí)間和產(chǎn)生的廢液總量

表2. 每個(gè)蛋白質(zhì)的氨基酸序列

加粗的DG表示使用了Asp(OtBu)-(DMB)Gly

圖1.泛素樣品粗制（1、2）和純化后（3、4）的UPLC-MS 分析

圖2.原胰島素粗樣品粗制(1、2)和純化后(3、4)的 UPLC-MS 分析

圖3.芽孢桿菌RNA酶樣品粗制(1、2)和純化后(3、4)的 UPLC-MS 分析

圖5.膠原蛋白樣品粗制(1、2)和純化后(3、4)的 UPLC-MS 分析

圖6.MDM2樣品粗制(1、2)和純化后(3、4)的 UPLC-MS 分析